El Instituto Nacional de Investigaciones Agropecuarias – INIAP, apoya activamente a instituciones educativas de tercer nivel en su labor de formación académica de nuevos profesionales. Entre estas instituciones se encuentra: el Instituto Agropecuario Superior Andino – IASA, donde el INIAP imparte conocimientos en control biológico, forestería y procesamiento de maderas.

Además en la Universidad Central del Ecuador, el INIAP colabora con estudiantes de cuarto nivel en maestrías en biotecnología, y también en la Escuela Superior Politécnica del Litoral – ESPOL, se contribuye al desarrollo de conocimientos en áreas estratégicas como agroindustria, estudios de mercado y caracterización de arroz.